Palabras clave
inferencia
redes ecológicas
teoría de sistemas
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Resumen
Los microbios alojados en nuestro cuerpo y planeta proveen muchos servicios esenciales para la salud humana. Mapear las redes ecológicas subyacentes a estas comunidades microbianas es un paso necesario para poder predecir su comportamiento, abriendo la puerta para crear nuevos tratamientos para enfermedades humanas y muchas otras condiciones. Sin embargo, los algoritmos existentes para mapear estas redes ecológicas microbianas no han sido muy exitosos. Esto es principalmente debido a que requieren asumir un modelo dinámico poblacional particular para la comunidad –que nunca es conocido a-priori– y siempre arrojan una sola red ecológica como resultado de la inferencia, a pesar de que puede haber varias redes ecológicas que son consistentes con los datos disponibles. Para superar estos retos, aquí desarrollamos un nuevo algoritmo de inferencia matemáticamente riguroso que no requiere asumir ningún modelo poblacional y que infiere todas las redes ecológicas que son consistentes con los datos. Ilustramos nuestro algoritmo con datos simulados y validamos su desempeño usando datos experimentales. Argumentamos como el algoritmo propuesto puede ser un paso clave para modelar ecológicamente comunidades microbianas complejas como el microbiota intestinal humano.
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